代谢流

代谢流分析(metabolic flux analysis)通过稳定同位素示踪结合质谱检测,追踪标记原子在代谢通路中的流向与速率,定量刻画中心碳代谢、氨基酸及脂质等代谢网络的通量分布,是代谢调控机制研究的核心工具。

原理介绍

代谢流(Metabolic Flux)分析利用稳定同位素示踪技术(如 [U-13C] glucose、[1,2-13C] glucose),检测下游代谢产物的同位素标记模式(质量分布向量 MDV),从而推算化合物在代谢通路中的流向和分布,得到特定代谢通路的活跃程度。常规代谢组学检测的是静态代谢物浓度,但代谢物积累既可能源于产量增加,也可能源于消耗减少;同位素标记的代谢流方法可直接追踪代谢物流向。例如以 [1,2-13C] glucose 为示踪剂:经糖酵解代谢时 2 个 13C 均进入丙酮酸(M+2 占 50%);经戊糖磷酸途径时 1 个 13C 以 CO2 排出(M+1 占 50%),根据 M+0、M+1、M+2 同位素相对丰度即可粗略估算两条通路对葡萄糖消耗的贡献。检测采用 Thermo Q-Exactive plus 高分辨质谱联用 Vanquish UPLC 系统(HILIC 色谱柱),并对天然稳定同位素丰度进行校正以获得真实 MDV。

实验流程

1

同位素标记

细胞/微生物培养或动物喂食含稳定同位素示踪剂(如 [U-13C] glucose)的培养基/饲料,设置时间梯度采样,追踪代谢动态流向

2

样品制备

细胞/微生物加冷提取液(甲醇:乙腈:水=2:2:1)超声破碎并低温离心;组织匀浆冰上孵育后同法离心,取上清液转移保存待冻干。

3

浓缩复溶

将样品上清液彻底冻干以去除残余有机溶剂,测定前以50 μL甲醇:水=1:1复溶液充分重悬,涡旋离心后取上清上机备测,保障进样稳定。

4

LC-MS 检测

Vanquish UPLC 串联 Q-Exactive plus 质谱,ZIC-HILIC 色谱柱分离,柱温45℃采集代谢物信号。

5

数据分析

TraceFinder/Xcalibur处理数据,计算质量分布向量(MDV/MID),天然同位素丰度校正获得Corrected MDV。

6

统计分析

同位素分布差异分析(柱状图,t-test p<0.05)、差异代谢物聚类分析(热图),并结合通路富集解析代谢流向变化,揭示代谢重塑规律。

送样标准

样本类型

动物组织、细胞、血浆/血清、尿液、脑脊液与植物、微生物样本等。

组织样本

送样 80 mg(风险 50 mg);送样重复数建议 ≥ 8。

血浆/血清

送样 200 μL(风险 80 μL);血浆抗凝剂优先用肝素钠。

细胞

需按靶向代谢标准提供足量细胞,具体根据同位素示踪实验设计咨询售前。

保存与运输

-80℃ 保存推荐 3 年以内;分装避免反复冻融,干冰运输;液体样本液氮速冻 2 min 再 -80℃ 保存。

交付内容

原始数据

质谱下机原始文件(RAW 格式)、样本信息表、QC 与仪器校准记录;

代谢物同位素分布分析结果

各代谢物保留时间、m/z、峰面积、MDV 及天然同位素校正后的 Corrected MDV 数据表;

同位素分布差异分析结果

比较组 MDV 柱状图,t-test p<0.05 显著性标注与差异代谢物列表;

差异代谢物聚类分析热图

基于 Corrected MDV 显著差异代谢物的层次聚类热图(Z-score 标准化);

实验质控

QC 样本 RSD 分布图(RSD<30%,样本数≥10 穿插 QC)与质控合格判定报告;

样本信息与分组信息表

含时间点、示踪剂类型(如 [U-13C] glucose)、生物学重复编号的完整样本元数据表;

结题报告

含完整方法描述、结果图表与解读的代谢流分析 PDF 报告及全部结果附件。

常见问题

常规代谢组学检测的是静态的代谢物浓度,而代谢流利用稳定同位素示踪技术追踪代谢物的流向和分布(如同追踪道路上的车流量),能反映特定代谢通路的活跃程度,区分代谢物积累是产量增加还是消耗减少所致。

天然稳定同位素(如 13C、2H、17O)也会造成较高的质量数,测得的 M+1 可能来自 1 个 13C 标记、1 个 2H 或 1 个 17O 等多种情况的总和,因此必须矫正元素的天然同位素丰度,才能获得真实的质量分布向量(Corrected MDV)。

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