转录组学
精准捕捉基因表达动态，揭示调控机制，为您还原不同实验条件下基因的响应模式。
circRNA 测序
环状RNA(circRNA)是一类共价闭合、无5'帽子和3' poly(A)尾的非编码RNA分子，最早于1970年代在病毒中发现，但长期被视为剪接副产物。近年来高通量测序技术的发展揭示其在真核生物中广泛存在，并具有组织/发育阶段特异性表达特征。circRNA主要由反向剪接（back-splicing）形成，即下游剪接供体与上游剪接受体连接成环。其结构稳定（抗RNase R降解）、保守性强，在调控基因表达、miRNA海绵（sponge）、蛋白质互作及翻译等方面发挥重要功能，与癌症、神经退行性疾病、心血管疾病等密切相关。
原理介绍
circRNA研究的核心原理是基于其反向剪接的特性和环状结构。区别于传统的线性RNA剪接（将外显子按基因组顺序连接），circRNA通过下游的5’剪接位点与上游的3’剪接位点共价连接，形成环状结构。 circRNA 測序 circRNA研究的核心原理是基于其反向剪接的特性和环状结构。区别于传统的线性RNA剪接（将外显子按基因组顺序连接），circRNA通过下游的5’剪接位点与上游的3’剪接位点共价连接，形成环状结构。
文献案例
《Nat Commun》期刊发表 Zheng 等研究 "Circular RNA profiling reveals an abundant circHIPK3 that regulates cell growth by sponging multiple miRNAs"，首次系统揭示了 circHIPK3 作为环状 RNA 的核心功能。circHIPK3 由 HIPK3 基因第 2 外显子经反向剪接（back-splicing）成环，在多种人类组织中广泛表达。该研究显示，circHIPK3 通过 miRNA 海绵（ceRNA）机制吸附 miR-124、miR-29、miR-379 等多个 miRNA，解除其对下游靶基因（如 IL6R、DLGAP1、BCL2 等）的抑制，从而调控细胞增殖、凋亡与血管新生。在膀胱癌、肝细胞癌、肺癌、结直肠癌等多种肿瘤中，circHIPK3 均呈现高表达并参与肿瘤进展。作为 circRNA 行使 ceRNA 功能的经典模型，circHIPK3 确立了环状 RNA 在基因表达调控网络中的关键节点地位，为后续非编码 RNA 研究奠定重要基础。
送样标准
≥ 5 × 10⁶ 个。用足量TRIzol或专用保护剂充分裂解后，-80℃保存。或制备成细胞沉淀，速冻后保存。确保细胞活性 >95%，彻底去除培养基。避免使用影响RNA提取的试剂（如肝素）。
≥ 50 mg。离体后迅速用预冷的PBS冲洗，切成≤ 50 mg的小块，立即投入液氮速冻，随后-80℃保存。心、肝、脾等富含核酸酶的器官，处理速度需更快。避免反复冻融。
≥ 100 mg。选取新鲜幼嫩部位，用液氮速冻后研磨成粉末，-80℃保存。多酚多糖含量高的物种，建议咨询特殊处理方案。
≥ 4 mL。使用EDTA或柠檬酸钠抗凝管采集，4℃暂存，6小时内完成白细胞分离或总RNA提取。严禁使用肝素抗凝管，它会严重抑制后续酶反应。
≥ 2 mL。采血后2小时内，3000g离心10分钟分离，分装后-80℃保存。避免溶血，溶血会释放大量背景RNA干扰检测。
5-10片（厚度5-10 μm） 。提供未染色的连续切片，置于无RNA酶的载玻片或离心管中。需同步提供对应的H&E染色切片用于病理评估，并注明切片日期。
交付内容
样品质量与相关性评估
基于circRNA表达量的样品间相关性热图，主成分分析（PCA）图，直观展示组间差异与组内重复性，circRNA全景鉴定与注释，circRNA可变环化分析。
高级深度分析模块
差异表达circRNA分析，差异表达circRNA列表（包含表达量、差异倍数、P值及FDR值），差异表达火山图与聚类热图。
宿主基因功能与通路富集
基因本体论（GO）富集分析，KEGG通路富集分析，Reactome通路富集分析。
竞争性内源RNA（ceRNA）调控网络预测
靶向miRNA预测，circRNA-miRNA-mRNA调控网络构建，扩展功能预测。
定制化分析模块
融合基因来源环状RNA（f-circRNA）分析。
常见问题
金标准是：① 跨反向剪接点设计发散性引物进行qRT-PCR验证；② Sanger测序确认剪接点序列；③ 使用Northern Blot，观察其迁移位置与线性RNA不同，且对RNase R有抗性。
目前常用规则是：以来源基因名称为基础，加上前缀“circ-”。例如，由基因HIPK3产生的环状RNA可命名为circHIPK3。若一个基因产生多个circRNA，则按发表顺序或环化外显子编号区分（如circHIPK3_2, circHIPK3_exon2等）。
